A necessidade de implantar a APAE em São Roque do Canaã, foi identificada na Conferência Municipal de Assistência Social, realizada em 03/11/1999 tendo em vista o grande número de pessoas portadoras de deficiência atendidas na APAE de Colatina através de um convênio com a Prefeitura de São Roque do Canaã, e também pela demanda reprimida.