Em 10 de outubro de 1992 foi fundada a Federação das Apaes do Estado do Espírito Santo (FEAPAES). Na ocasião o Espírito Santo possuía 16 Apaes. A Sra. Maria Luíza Dadalto, então vice-presidente da 8ª Regional Leste da Federação Nacional (que congregava as APAEs capixabas) foi eleita a presidente da nova entidade.
As primeiras atividades foram desenvolvidas nas dependências da APAE de Vitória, instituição fundada em 27 de maio de 1965 e a primeira Apae do Estado.No ano de 1997 a Federação das Apaes do Espírito Santo passou a realizar suas atividades em uma sede própria.